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It’s Science, but Not Necessarily Right

La aplicación del método científico con el debido rigor metodológico permite a otros investigadores, repetir los experimentos y comprobar las hipótesis planteadas, sin embargo esta práctica es lenta y muchos científicos consideran esta práctica una pérdida de tiempo. No obstante si los científicos probáramos muchas de las verdades que se publican el avance de la ciencia contaría con caminos más claros y menos distracciones. Carl Zimmer ha publicado recientemente un artículo que trata este tema y que nos lleva a la reflexión. June 25, 2011

 It’s Science, but Not Necessarily Right

By CARL ZIMMER

[NyTimes.com]

ONE of the great strengths of science is that it can fix its own mistakes. “There are many hypotheses in science which are wrong,” the astrophysicist Carl Sagan once said. “That’s perfectly all right: it’s the aperture to finding out what’s right. Science is a self-correcting process.”

If only it were that simple. Scientists can certainly point with pride to many self-corrections, but science is not like an iPhone; it does not instantly auto-correct. As a series of controversies over the past few months have demonstrated, science fixes its mistakes more slowly, more fitfully and with more difficulty than Sagan’s words would suggest. Science runs forward better than it does backward.

Why? One simple answer is that it takes a lot of time to look back over other scientists’ work and replicate their experiments. Scientists are busy people, scrambling to get grants and tenure. As a result, papers that attract harsh criticism may nonetheless escape the careful scrutiny required if they are to be refuted.

In May, for instance, the journal Science published eight critiques of a controversial paper that it had run in December. In the paper, a team of scientists described a species of bacteria that seemed to defy the known rules of biology by using arsenic instead of phosphorus to build its DNA. Chemists and microbiologists roundly condemned the paper; in the eight critiques, researchers attacked the study for using sloppy techniques and failing to rule out more plausible alternatives.

But none of those critics had actually tried to replicate the initial results. That would take months of research: getting the bacteria from the original team of scientists, rearing them, setting up the experiment, gathering results and interpreting them. Many scientists are leery of spending so much time on what they consider a foregone conclusion, and graduate students are reluctant because they want their first experiments to make a big splash, not confirm what everyone already suspects.

“I’ve got my own science to do,” John Helmann, a microbiologist at Cornell and a critic of the Science paper, told Nature. The most persistent critic, Rosie Redfield, a microbiologist at the University of British Columbia, announced this month on her blog that she would try to replicate the original results — but only the most basic ones, and only for the sake of science’s public reputation. “Scientifically I think trying to replicate the claimed results is a waste of time,” she wrote in an e-mail.

For now, the original paper has not been retracted; the results still stand.

Even when scientists rerun an experiment, and even when they find that the original result is flawed, they still may have trouble getting their paper published. The reason is surprisingly mundane: journal editors typically prefer to publish groundbreaking new research, not dutiful replications.

In March, for instance, Daryl Bem, a psychologist at Cornell University, shocked his colleagues by publishing a paper in a leading scientific journal, The Journal of Personality and Social Psychology, in which he presented the results of experiments showing, he claimed, that people’s minds could be influenced by events in the future, as if they were clairvoyant.

Three teams of scientists promptly tried to replicate his results. All three teams failed. All three teams wrote up their results and submitted them to The Journal of Personality and Social Psychology. And all three teams were rejected — but not because their results were flawed. As the journal’s editor, Eliot Smith, explained to The Psychologist, a British publication, the journal has a longstanding policy of not publishing replication studies. “This policy is not new and is not unique to this journal,” he said.

As a result, the original study stands.

Even when follow-up studies manage to see the light of day, they still don’t necessarily bring matters to a close. Sometimes the original authors will declare the follow-up studies to be flawed and refuse to retract their paper. Such a standoff is now taking place over a controversial claim that chronic fatigue syndrome is caused by a virus. In October 2009, the virologist Judy Mikovits and colleagues reported in Science that people with chronic fatigue syndrome had high levels of a virus called XMRV. They suggested that XMRV might be the cause of the disorder.

Several other teams have since tried — and failed — to find XMRV in people with chronic fatigue syndrome. As they’ve published their studies over the past year, skepticism has grown. The editors of Science asked the authors of the XMRV study to retract their paper. But the scientists refused; Ms. Mikovits declared that a retraction would be “premature.” The editors have since published an “editorial expression of concern.”

Once again, the result still stands.

But perhaps not forever. Ian Lipkin, a virologist at Columbia University who is renowned in scientific circles for discovering new viruses behind mysterious outbreaks, is also known for doing what he calls “de-discovery”: intensely scrutinizing controversial claims about diseases.

Last September, Mr. Lipkin laid out several tips for effective de-discovery in the journal Microbiology and Molecular Biology Reviews. He recommended engaging other scientists — including those who published the original findings — as well as any relevant advocacy groups (like those for people suffering from the disease in question). Together, everyone must agree on a rigorous series of steps for the experiment. Each laboratory then carries out the same test, and then all the results are gathered together.

At the request of the National Institutes of Health, Mr. Lipkin is running just such a project with Ms. Mikovits and other researchers to test the link between viruses and chronic fatigue, based on a large-scale study of 300 subjects. He expects results by the end of this year.

This sort of study, however, is the exception rather than the rule. If the scientific community put more value on replication — by setting aside time, money and journal space — science would do a better job of living up to Carl Sagan’s words.

Carl Zimmer writes frequently for The New York Times about science and is the author, most recently, of “A Planet of Viruses.”

[NyTimes.com]

Community Participation in Chagas Disease Vector Surveillance: Systematic Review

Resumen Introducción: El control de vectores ha reducido sustancialmente la incidencia de la enfermedad de Chagas; con todo, la transmisión mediada por triatominos capaces de reinfestar viviendas persiste. La vigilancia entomológica es, por tanto, crucial, para la interrupción de la transmisión a largo plazo. Sin embargo, los focos de infestación son cada vez más pequeños y difíciles de detectar a medida que el control avanza, haciéndose necesario desarrollar métodos de vigilancia más sensibles. La participación de la comunidad y diversos tipos de aparatos detectores de vectores podrían mejorar el desempeño de la vigilancia, pero no existe, hasta el momento, una evaluación exhaustiva de esta idea.

Metodología/Resultados Principales: Realizamos búsquedas bibliográficas en Medline, Web of Knowledge, Scopus, LILACS, SciELO, las referencias de los estudios recuperados y nuestros propios archivos. Los datos de estudios que describen intervenciones de control y/o vigilancia de vectores fueron extraídos por dos revisores. Los resultados de interés primario incluyeron cambios en las tasas de infestación y la detección de focos de infestación/reinfestación. La probable dependencia de la mayoría de los resultados de las condiciones específicas de cada estudio y localidad impidió la realización de meta-análisis, pero reanalizamos, siempre que nos fue posible, los datos de estudios comparativos sobre métodos de control y detección de vectores. Los resultados confirman que la aplicación de insecticidas por profesionales es altamente efectiva, pero muestran también que la reinfestación por triatominos nativos es frecuente y se extiende por toda América Latina. La notificación de insectos sospechosos por los habitantes (la estrategia participativa más sencilla) incrementa de forma notable las probabilidades de detección de vectores; en comparación, tanto las búsquedas activas cuanto los aparatos detectores tienen un desempeño muy pobre, aunque es posible que se complementen en ciertos casos.

Conclusiones/Importancia: La participación de la comunidad debería convertirse en un componente estratégico de la vigilancia de la enfermedad de Chagas; sin embargo, sólo la aplicación profesional de insecticidas parece ser consistentemente efectiva en la eliminación de focos de infestación. Estas estrategias participativas probablemente mejorarían si se garantizase la participación efectiva de todos los actores en las diferentes fases del proceso, desde la planificación a la evaluación.

Chagas Disease among the Latin American Adult Population Attending in a Primary Care Center in Barcelona, Spain

Introduction [PLoS NTDS] Trypanosoma cruzi (T. cruzi) is a flagellate protozoan that causes Chagas disease (CD). It is traditionally linked to rural areas of continental Latin America, where it is transmitted by a variety of bug vectors. In recent decades, the epidemiological pattern of this disease has undergone considerable changes. In the endemic countries of Latin America, the regional Chagas programs are working to interrupt vector-borne and transfusional transmission, to control congenital Chagas disease and to support initiatives aimed at improving diagnosis, management and surveillance of the disease. In non-endemic countries that receive immigrants from Latin America or send tourists to endemic areas, CD is an emerging disease and has become a public health problem because it can be transmitted by non-vectorial mechanisms.

Spain is a major European host country for people from Latin America. According to the Spanish National Institute of Statistics, in 2009 more than 1.8 million immigrants from Latin America were registered, accounting for 3.85% of the total population. In recent years several studies of CD in non-endemic countries have focused in particular on non-vectorial transmission mechanisms such as pregnancy and childbirth, blood transfusion and organ transplantation. However, when reviewing the literature we found little information on imported CD in non-endemic countries at the primary care level, which is ideal for screening the general population.

The clinical manifestations of chronic T. cruzi infection include the latent form (the indeterminate chronic form), which occurs in 60% of cases, the cardiac form, the digestive or cardiodigestive form, and sudden death. Therefore, many diagnoses of CD are based on epidemiological suspicion rather than clinical signs and symptoms.

The objectives of the present study were to assess the prevalence of Trypanosoma cruzi infection in the adult Latin American population treated at a health center in Barcelona, Spain; to analyze the clinical phase of the disease; and to determine whether screening for imported CD in primary care should be recommended.

Read full article [PLoS NTDS]

Roca C, Pinazo MJ, López-Chejade P, Bayó J, Posada E, et al. (2011) Chagas Disease among the Latin American Adult Population Attending in a Primary Care Center in Barcelona, Spain. PLoS Negl Trop Dis 5(4): e1135. doi:10.1371/journal.pntd.0001135

Generation of New Drugs for Neglected Tropical Diseases

Sanofi and DNDi - Drugs for Neglected Diseases initiative - Sign an Innovative Agreement to Generate New Drugs for Neglected Tropical Diseases. Sanofi and Drugs for Neglected Diseases initiative announced a three-year research collaboration agreement for the research of new treatments for nine neglected tropical diseases (NTDs), listed by the World Health Organization (WHO) for which new, adapted, and efficient tools are urgently needed to treat patients in endemic countries. This agreement is built upon a history of successful collaboration between Sanofi and DNDi.

In the framework of this agreement, Sanofi will initially bring molecules from its libraries into the partnership, while DNDi and Sanofi collaborate in research activities on innovative molecular scaffolds. The core of the agreement lies in the innovative management of intellectual property generated through the collaboration. The rights to results produced by this partnership will be co- owned by Sanofi and DNDi. The partners will facilitate publication of the results to ensure access to the wider community of researchers focusing on NTDs. The public sector will benefit from the drugs developed through this agreement under the best possible conditions to ease access for patients in all endemic countries, irrespective of their level of economic development.

Neglected Tropical Diseases covered by the agreement

This agreement covers nine neglected tropical diseases (NTDs): kinetoplastid diseases (leishmaniases, Chagas disease, and human African trypanosomiasis), helminth infections (lymphatic filariasis, onchocerciasis, and soil-transmitted helminthiasis), and dracunculiasis, fascioliasis, and schistosomiasis.

[Press Release]

Investigación en Latinoamérica

[SciDev.net] La producción científica de América Latina y el Caribe sigue creciendo, pero continúa rezagada con respecto al promedio mundial, de acuerdo con un ranking de casi 1.400 instituciones de investigación publicado la semana pasada (10 de mayo). Las instituciones de educación superior (IES) de Brasil, México, Argentina y Chile, en orden descendiente, tuvieron la mayor producción de la región en el período 2005-2009, seguidas por Colombia, Venezuela y Cuba.

Brasil domina en el campo de la investigación, con alrededor de 163 mil publicaciones científicas, 98 por ciento de las cuales provienen de la educación superior. Entre las diez universidades más productivas de la región, siete son brasileras, encabezadas por la Universidad de Sao Paulo.

El estudio de los Scimago Institutions Rankings (SIR) de España mide la producción científica, tasas de colaboración internacional, impacto y porcentaje de documentos publicados en revistas de prestigio internacional de las IES de América Latina y el Caribe, Portugal y España.

“La mayoría de las investigaciones producidas provienen de unas pocas universidades debido a que éstas reciben la mayor cantidad de recursos para la investigación”, dijo. “Por ejemplo, en Brasil los fondos para investigación están demasiado concentrados en el estado de Sao Paulo”.

Una de las razones por las cuales la producción científica de la región es escasa, dijo de Moya, es que la comunidad de investigadores activos internacionalmente es pequeña, como también lo es el porcentaje del PIB dedicado a la investigación.

Informe completo en [SciDev.net]

Ranking de SIR [pdf]

Neike.com.py

Científicos paraguayos investigan un nuevo fármaco contra el Chagas y la leishmaniosis

[Neike.com.py] Un equipo de científicos paraguayos trabaja junto a sus pares de América Latina para darle una esperanza a los 16 millones de infectados de la región. El Centro para el Desarrollo de la Investigación Científica (CEDIC) recibió una mención de honor en el Premio Nacional de Ciencia 2010 por su labor relacionada a la búsqueda de sustancias contra la enfermedad de Chagas y las leishmaniosis. Hasta ahora han probado la efectiva actividad sobre los parásitos a nivel celular de cinco compuestos químicos derivados de un musgo descubierto en Europa Central.

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Homenaje a la Dra. Antonieta Rojas de Arias

El Viernes 26 de Noviembre se realizó la 1era Muestra Nacional de Epidemiología del Paraguay, momento en el cual se aprovecho para rendir un homenaje a la Dra. Antonieta Rojas de Arias, Investigadora del CEDIC, por su trayectoria en el campo de la Vigilancia de la Salud, y sus aportes a la especialidad.

Junto con la Dra. Antonieta Rojas, también fueron homenajeadas otras tres mujeres: Las doctoras Cynthia Prieto Conti, Agueda Cabello y la Sra. Eloisa Campos.

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Mención de Honor a la Dra. Rojas de Arias

[OPS.org/par]  La Dra. Antonieta Rojas de Arias, Consultora Nacional de la OPS/OMS en Paraguay, junto con un equipo de investigadores nacionales e internacionales,  Dra. Miriam Rolón, Dra. María Celeste Vega y Dr. Enrique Pandolfi, recibió la Mención de Honor por el trabajo investigación  "Potente actividad antiparasitaria de nuevos derivados poli fenólicos en el tratamiento experimental de agentes etiológicos de la enfermedad de Chagas y la leishmaniasis visceral".

Este Trabajo fue financiado por la Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT)  en la primera convocatoria de Proyectos Nacionales en el 2008 y fue desarrollado por un período de 12 meses, por los investigadores mencionados del Centro para el Desarrollo de la Investigación Científica (CEDIC) en colaboración con el Dpto. de Química Orgánica de la Universidad de la Republica del Uruguay.

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Daño y Reparación del ADN

 

El Lunes 15 al 26 de noviembre, empieza el curso sobre "Daño y Reparación del ADN" en el IIBCE, Uruguay,   Sala Francisco A. Sáez y Departamento de Genética. El curso estará dirigido por Dr. Wilner Martínez-López del Laboratorio de Epigenética e Inestabilidad Genómica, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable, y la Dra. Elia Nunes Laboratorio de Radiobiología, Departamento de Biofísica, Facultad de Medicina.

Los Temas a desarrollarse son:

Parte 1 (Noviembre 15-19, Departamento de Genética, IIBCE)

I Daño Genético:

a) Mutaciones en el ADN

b) Aberraciones Cromosómicas

c) Muerte Celular

II. Factores relacionados con la inducción de daño genético

a) Agentes

b) Ciclo Celular

c) Organización de la Cromatina

d) Reparación del ADN

III. Métodos de evaluación del daño genético

Parte 2 (Noviembre 22-26, Lab. de Radiobiología, Fac. de Medicina)

I.    Mecanismos de reparación de lesiones en el ADN. Modelos moleculares y métodos de estudio

II.   Mecanismos de protección frente a radiaciones y lesiones oxidativas. Modelos de protección redox

III.  Control del ciclo celular: regulación y  relación con la reparación y la protección  del ADN

Ademas se desarrollaran temas del trabajo experimental:

I. Efectos moleculares y celulares de un  radiomimético sobre poblaciones  celulares. Modulación por radioprotectores de origen natural

II. Estimación de probabilidades de sobrevida y mutagénesis en función de la  dosis de agentes genotóxicos

III. Determinación de roturas dobles de ADN. Introducción  a la metodología. Significado biomédico

El CEDIC está presente en estos cursos con la presencia de Andrés Mojoli Lequesne.

 

Mención de Honor a Investigadores del CEDIC

[Ultimahora.com] El Dr. Antonio Arbo es el ganador del Premio Nacional de Ciencia 2010, otorgado por la Cámara de Senadores, según anunció ayer el presidente de la Cámara Alta, Óscar González Daher. El Dr. Manuel Silvero Arévalos, miembro del jurado en representación de la Universidad Nacional de Asunción - Rectorado (UNA), mencionó otros trabajos relevantes que recibirán menciones de honor. El primero de ellos, "Potente actividad antiparasitaria de nuevos derivados polifenólicos en el tratamiento experimental de agentes etiológicos de la enfermedad de Chagas y la leishmaniasis visceral", de los coautores Dra. Antonieta Rojas de Arias, Dra. Miriam Rolón, Dra. María Celeste Vega y Dr. Enrique Pandolfi.

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Métodos Básicos en Proteómica

Desde el 25 de Octubre se viene realizando un curso/taller de "Métodos Básicos en Proteómica" en el Departamento de Biología Molecular y Genética, Instituto de Investigaciones en Ciencias de la Salud (IICS), Universidad Nacional de Asunción (UNA).

El objetivo del curso es dar un entrenamiento intensivo en métodos básicos de proteómica, El curso cuenta con clases teóricas de la disciplina, integradas a un programa de trabajos prácticos,  totalizando 40 horas de actividad. Se hará especial énfasis en:

  • Introducción general al análisis proteómico
  • Electroforesis bidimensional de proteínas
  • Espectrometría de Masa en el análisis de proteínas
  • Identificación de proteínas  en bases de datos

Los organizadores son Adriana Parodi-Talice, Ph.D., Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Uruguay, y Carlos Batthyány, MD, Ph.D., Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay.

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Regulaçâo Epigenetica do Genomas de Plantas

Nuestra compañera de trabajo Fabiola Roman se encuentra realizando un curso de "Regulaçâo Epigenetica do Genomas de Plantas" en el Instituto de Bioquímica Medica de la Universidad Federal do Rio Janeiro, especificamente en el Laboratorio de Biologia Molecular de Plantas. El curso inicio el 18 de octubre y culmina el 29 de octubre. El coordinador encargado es el Dr.Paulo Cavalcanti Gomez Ferreira, del Instituto de Bioquimica Medica,UFRJ,Brasil.

El curso fue financiado por el Centro Brasilero Argentino de Biotecnologia (CBAB - CABBIO) y los temas tratados fueron

  • Construction of Degradomes Libraries
  • Small RNAs libraries
  • Chip - Sec

 

Fondo Global

Se lleva a cabo en la ciudad de Evian, Francia (16 al 30 de octubre) la reunion anual del Panel Revisor Tecnico del Fondo Global, donde se evaluan propuestas de paludismo, tuberculosis y HIV provenientes del todo el mundo. La Dra Antonieta Rojas de Arias, investigadora del CEDIC, participa como miembro permanente de este Panel. El Fondo Global es una Institucion Financiera Internacional que invierte el dinero del mundo en salvar vidas. Hasta ahora ha invertido 19.3 billones de dolares en la prevencion, el tratamiento y en programas de salud que se llevan a cabo contra estas  tres enfermedades.

 

Eric van Praag de Tanzania, Antonieta Rojas de Arias de Paraguay, Claudia Surjadjaja de Indonesia, Peter Barrom de Sudafrica, y Amed Adeed de Sudan.

CEDIC en MSN latinoamerica

(LATAM MSN) ASUNCIóN, Paraguay, oct. 18 - En Paraguay hay cerca de 150.000 personas infectadas con Chagas, pero la mayoría no lo saben, porque el mal tarda más 20 en manifestarse, dice un informe de Ultima Hora. Un grupo de seis investigadoras paraguayas del Centro para el Desarrollo de la Investigación Científica (CEDIC), realizaron una investigación a profundidad para descubrir el comportamiento peculiar de este insecto en las agrestes condiciones del Chaco y descubrieron que ciertos hábitos de los habitantes facilita el avance del mal.

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CEDIC - Chagas en Prensa Latina

(Prensa Latina) Una investigación para determinar el comportamiento del vector transmisor del Mal de Chagas en las condiciones agrestes del Chaco paraguayo concluyó en cuatro comunidades de esa región occidental, se conoció hoy. La pesquisa científica se desarrolló en los últimos dos años en forma simultánea en Argentina, Bolivia y Paraguay y tuvo el apoyo del Centro Internacional de Investigaciones para el Desarrollo (IDRC).

El estudio se denominó "Perspectiva ecosistémica del proceso de reinfestación con Triatoma infestans en comunidades rurales de la ecorregión del Gran Chaco", y fue realizado por seis investigadoras paraguayas del Centro para el Desarrollo de la Investigación Científica (CEDIC).

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En Paraguay 150 mil personas tienen Chagas, pero no lo saben

«En Paraguay hay cerca de 150.000 personas infectadas con Chagas, pero la mayoría no lo saben, porque este mal tarda más de veinte años en manifestarse. Sin embargo, la enfermedad es una de las menos estudiadas a nivel mundial.

Como se trata de una infección exclusiva del continente americano, son solamente los científicos locales los que pueden contribuir al descubrimiento de nuevas formas de combatir este mal.

Basadas en esta realidad, un grupo de seis investigadoras paraguayas del Centro para el Desarrollo de la Investigación Científica (CEDIC), realizaron una investigación a profundidad para descubrir el comportamiento peculiar de este insecto en las agrestes condiciones del Chaco.

El trabajo abarcó cuatro comunidades indígenas. Ellas son 12 de Junio, 10 Leguas, Campo Largo y Campo Alegre, y se realizó con el apoyo de la Fundación Moisés Bertoni, el Departamento de Investigación y Desarrollo, el Laboratorio Díaz Gill y el Programa Nacional de Chagas del Senepa.

"Es muchísimo lo que falta por conocer de esta enfermedad", expone la bióloga Miriam Rolón.»

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Felicidades

El trabajo liderado por una de nuestras investigadoras, la Dra. Miriam Rolón, conjuntamente con el Servicio Nacional de Control de Vectores, SENEPA denominado TÉCNICA DE ELISA PARA LA IDENTIFICACIÓN DE FUENTES ALIMENTARIAS DE T. infestans DEL CHACO PARAGUAYO por los autores Rolón, M; Vega, M.C, Gomez A; Roman F; Cousiño, B; Rojas de Arias, A, fue premiado en el 1er Congreso de Medio Ambiente y Desarrollo Sostenible fue premiado en el Primer Congreso Paraguayo sobre Medio Ambiente y Desarrollo Sostenible. Felicitaciones investigadoras!!!

Visitas al CEDIC

Hemos recibido la visita de los Doctores Alain Fournet del IRD de Francia, especialista en productos naturales y de la Dra. Maria Esther Bar, de la Universidad Nacional del Nordeste en Corrientes Argentina (UNNE), con amplia experiencia en ecoepidemiología de la enfermedad de Chagas. Esta visita se realizo dentro del marco del 1er Congreso de Medio Ambiente y Desarrollo Sostenible, donde estuvimos como organizadores. Ambos estuvieron visitando el laboratorio y discutiendo con nosotros posibles colaboraciones.